MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 chromosome

Total Repeats: 37973

< Previous12...678910111213141516...7576Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_013416	CCG	2	6	286077	286082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867018
5003	NC_013416	CAT	2	6	286083	286088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867018
5004	NC_013416	A	6	6	286475	286480	100 %	0 %	0 %	0 %	261867019
5005	NC_013416	GCA	2	6	286481	286486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867019
5006	NC_013416	CAA	2	6	286492	286497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867019
5007	NC_013416	ATG	2	6	286502	286507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867019
5008	NC_013416	GCA	2	6	286684	286689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867020
5009	NC_013416	ACA	2	6	286736	286741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867020
5010	NC_013416	TTA	2	6	286789	286794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867020
5011	NC_013416	CCAC	2	8	286822	286829	25 %	0 %	0 %	75 %	261867020
5012	NC_013416	TGA	2	6	286868	286873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867020
5013	NC_013416	ATG	2	6	287561	287566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867021
5014	NC_013416	GCC	2	6	287602	287607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867021
5015	NC_013416	GC	3	6	287617	287622	0 %	0 %	50 %	50 %	261867021
5016	NC_013416	ATA	2	6	287651	287656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867021
5017	NC_013416	TGG	2	6	287694	287699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867021
5018	NC_013416	GCA	2	6	287758	287763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867021
5019	NC_013416	AGC	2	6	287797	287802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867021
5020	NC_013416	CAA	2	6	287905	287910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867021
5021	NC_013416	CGG	2	6	288054	288059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867021
5022	NC_013416	ACC	2	6	288144	288149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867021
5023	NC_013416	TGCT	2	8	288182	288189	0 %	50 %	25 %	25 %	261867021
5024	NC_013416	ACA	2	6	288192	288197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867021
5025	NC_013416	CAA	2	6	288253	288258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867021
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5031	NC_013416	CGT	2	6	288751	288756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867021
5032	NC_013416	GT	3	6	288773	288778	0 %	50 %	50 %	0 %	261867021
5033	NC_013416	TGG	2	6	288779	288784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867021
5034	NC_013416	TTG	2	6	288850	288855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867021
5035	NC_013416	TGA	2	6	288915	288920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867021
5036	NC_013416	A	6	6	288944	288949	100 %	0 %	0 %	0 %	261867021
5037	NC_013416	GCA	2	6	288983	288988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867021
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5041	NC_013416	AAG	3	9	289205	289213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867021
5042	NC_013416	AAAAAC	2	12	289220	289231	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	261867021
5043	NC_013416	AAC	2	6	289313	289318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867021
5044	NC_013416	GCAA	2	8	289338	289345	50 %	0 %	25 %	25 %	261867021
5045	NC_013416	CAG	2	6	289367	289372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867021
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5050	NC_013416	AAT	2	6	289882	289887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867022
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5052	NC_013416	CTT	2	6	290074	290079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261867022
5053	NC_013416	TGC	2	6	290111	290116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867022
5054	NC_013416	GTAA	2	8	290168	290175	50 %	25 %	25 %	0 %	261867022
5055	NC_013416	ATA	2	6	290221	290226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867022
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5060	NC_013416	AACC	2	8	290783	290790	50 %	0 %	0 %	50 %	261867023
5061	NC_013416	TTGGTG	2	12	290802	290813	0 %	50 %	50 %	0 %	261867023
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5103	NC_013416	CTTG	2	8	292945	292952	0 %	50 %	25 %	25 %	261867026
5104	NC_013416	CATT	2	8	292988	292995	25 %	50 %	0 %	25 %	261867026
5105	NC_013416	ATG	2	6	292999	293004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867026
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5112	NC_013416	TG	3	6	293460	293465	0 %	50 %	50 %	0 %	261867028
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5118	NC_013416	TTG	2	6	293588	293593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867028
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5123	NC_013416	GAA	2	6	293761	293766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867028
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5234	NC_013416	CTG	2	6	300343	300348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867036
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5237	NC_013416	CGA	2	6	300498	300503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5238	NC_013416	CTG	2	6	300526	300531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5239	NC_013416	GC	4	8	300618	300625	0 %	0 %	50 %	50 %	261867036
5240	NC_013416	CCG	2	6	300639	300644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867036
5241	NC_013416	T	6	6	300671	300676	0 %	100 %	0 %	0 %	261867036
5242	NC_013416	CAA	2	6	300678	300683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867036
5243	NC_013416	ACG	3	9	300692	300700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5244	NC_013416	CTC	2	6	300732	300737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261867036
5245	NC_013416	GAA	2	6	300775	300780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867036
5246	NC_013416	GAC	2	6	300820	300825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5247	NC_013416	ACA	2	6	300848	300853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867036
5248	NC_013416	TCA	2	6	300863	300868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867036
5249	NC_013416	CAA	2	6	300891	300896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867036
5250	NC_013416	GCT	2	6	300933	300938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5251	NC_013416	CGCCT	2	10	300949	300958	0 %	20 %	20 %	60 %	261867036
5252	NC_013416	A	7	7	301005	301011	100 %	0 %	0 %	0 %	261867036
5253	NC_013416	CAT	2	6	301014	301019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867036
5254	NC_013416	CGC	2	6	301038	301043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867036
5255	NC_013416	CGG	2	6	301071	301076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867036
5256	NC_013416	A	6	6	301078	301083	100 %	0 %	0 %	0 %	261867036
5257	NC_013416	CTA	2	6	301128	301133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867036
5258	NC_013416	GCA	2	6	301227	301232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5259	NC_013416	CGC	2	6	301287	301292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867036
5260	NC_013416	CGT	2	6	301347	301352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5261	NC_013416	GAC	2	6	301372	301377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5262	NC_013416	CGT	2	6	301383	301388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5263	NC_013416	CGA	2	6	301434	301439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5264	NC_013416	CGC	2	6	301529	301534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867036
5265	NC_013416	CCG	2	6	301547	301552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867036
5266	NC_013416	ATT	2	6	301598	301603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867036
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5268	NC_013416	GCA	2	6	301715	301720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5269	NC_013416	GAC	2	6	301783	301788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5270	NC_013416	ACCA	2	8	301807	301814	50 %	0 %	0 %	50 %	261867036
5271	NC_013416	GAC	2	6	301816	301821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5272	NC_013416	GAC	2	6	301887	301892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5273	NC_013416	CCG	2	6	301910	301915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867036
5274	NC_013416	ACG	2	6	301928	301933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5275	NC_013416	CCT	2	6	301992	301997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261867036
5276	NC_013416	ACA	2	6	302006	302011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867036
5277	NC_013416	TGC	2	6	302012	302017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5278	NC_013416	A	6	6	302044	302049	100 %	0 %	0 %	0 %	261867036
5279	NC_013416	TCA	2	6	302066	302071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867036
5280	NC_013416	GCTACG	2	12	302118	302129	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5281	NC_013416	TCG	2	6	302130	302135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867036
5282	NC_013416	AACC	2	8	302167	302174	50 %	0 %	0 %	50 %	261867036
5283	NC_013416	CGA	2	6	302209	302214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867036
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5287	NC_013416	ACA	2	6	302403	302408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867037
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5290	NC_013416	GCA	2	6	302524	302529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867037
5291	NC_013416	CGA	2	6	302617	302622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867037
5292	NC_013416	CAT	2	6	302632	302637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867037
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5295	NC_013416	GAC	2	6	302756	302761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867037
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5297	NC_013416	CCT	2	6	302830	302835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261867037
5298	NC_013416	CGG	2	6	302848	302853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867037
5299	NC_013416	CTG	2	6	302885	302890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867037
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5301	NC_013416	TCA	2	6	303090	303095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867037
5302	NC_013416	CTG	2	6	303101	303106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867037
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5304	NC_013416	ACGACA	2	12	303195	303206	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	261867038
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5307	NC_013416	AGCA	2	8	303326	303333	50 %	0 %	25 %	25 %	261867038
5308	NC_013416	ACGAAA	2	12	303351	303362	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	261867038
5309	NC_013416	GCGG	2	8	303411	303418	0 %	0 %	75 %	25 %	261867038
5310	NC_013416	CA	3	6	303496	303501	50 %	0 %	0 %	50 %	261867038
5311	NC_013416	ATG	2	6	303561	303566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867038
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5313	NC_013416	GCT	2	6	303622	303627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867038
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5322	NC_013416	TGC	2	6	304035	304040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867038
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5331	NC_013416	AT	3	6	304655	304660	50 %	50 %	0 %	0 %	261867039
5332	NC_013416	TTA	2	6	304661	304666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867039
5333	NC_013416	ATC	2	6	304732	304737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867039
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5337	NC_013416	A	7	7	304815	304821	100 %	0 %	0 %	0 %	261867039
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5339	NC_013416	CG	3	6	304844	304849	0 %	0 %	50 %	50 %	261867039
5340	NC_013416	ACT	2	6	304879	304884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867039
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5344	NC_013416	A	6	6	305047	305052	100 %	0 %	0 %	0 %	261867039
5345	NC_013416	GGATT	2	10	305091	305100	20 %	40 %	40 %	0 %	261867039
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5347	NC_013416	GA	3	6	305189	305194	50 %	0 %	50 %	0 %	261867039
5348	NC_013416	GCA	2	6	305242	305247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867039
5349	NC_013416	TA	4	8	305251	305258	50 %	50 %	0 %	0 %	261867039
5350	NC_013416	CAA	2	6	305295	305300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867039
5351	NC_013416	AAT	2	6	305352	305357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261867040
5352	NC_013416	ACC	2	6	305441	305446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261867040
5353	NC_013416	CTG	2	6	305470	305475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867040
5354	NC_013416	TGA	2	6	305483	305488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867040
5355	NC_013416	A	6	6	305613	305618	100 %	0 %	0 %	0 %	261867041
5356	NC_013416	ACG	2	6	305700	305705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867041
5357	NC_013416	ATC	2	6	305720	305725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261867041
5358	NC_013416	A	7	7	305777	305783	100 %	0 %	0 %	0 %	261867041
5359	NC_013416	GAA	2	6	305789	305794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261867041
5360	NC_013416	CGG	2	6	305844	305849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261867041
5361	NC_013416	CGA	2	6	305920	305925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867041
5362	NC_013416	GGGCG	2	10	305980	305989	0 %	0 %	80 %	20 %	261867041
5363	NC_013416	GTT	2	6	305998	306003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867041
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5365	NC_013416	TGA	2	6	306028	306033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261867041
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5369	NC_013416	T	6	6	306118	306123	0 %	100 %	0 %	0 %	261867041
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5481	NC_013416	AT	3	6	311183	311188	50 %	50 %	0 %	0 %	261867045
5482	NC_013416	TCG	2	6	311216	311221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867045
5483	NC_013416	GGT	2	6	311283	311288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261867045
5484	NC_013416	TGC	2	6	311307	311312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	261867045
5485	NC_013416	GGTT	2	8	311314	311321	0 %	50 %	50 %	0 %	261867045
5486	NC_013416	ACG	2	6	311398	311403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261867045
5487	NC_013416	TCGCCA	2	12	311432	311443	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	261867045
5488	NC_013416	GTT	2	6	311507	311512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867045
5489	NC_013416	ATT	2	6	311521	311526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261867045
5490	NC_013416	CCG	2	6	311531	311536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261867045
5491	NC_013416	CAA	2	6	311608	311613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261867045
5492	NC_013416	CA	3	6	311688	311693	50 %	0 %	0 %	50 %	261867045
5493	NC_013416	TGT	2	6	311750	311755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261867045
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